AlphaFold 可能预测蛋白质结构 ，援手人类解决了几十年的生物难题 ，也拿了诺贝尔奖 ，全世界有几百万人使用它做钻研 。各人都知路 AlphaFold 由被谷歌收购的 DeepMind 研发而来 ，事实上谷歌在英国伦敦还养着一家名为 Isomorphic Labs 的公司 ，专门钻研若何用 AI 设计新药 。
这个被谷歌独享的 AI 到底严害在哪里？这要先从 AlphaFold 3 说起 ，AlphaFold 3 已经可能预测蛋白质和幼分子的结合方式 ，这对于找到新药极度沉要 。药物要想起作用 ，就像钥匙插进锁孔一样 ，刚好卡在蛋白质的某个地位上 。但是 ，光知路地位还不够 ，还得知路这把钥匙插得有多紧 。松的注定起不到作用 ，太紧了则可能有副作用 。
以前测试松紧度的时辰 ，得使用物理学步骤慢慢推算 ，算一次可能得几天甚至几周 ，花钱并且费劲 。2025 年 ，领域内出现一个名为 Boltz-2 的开源模型 ，已经可能做到使用 AI 预测结合强度 ，快率比物理学步骤快好多 。
而 IsoDDE 比 Boltz-2 还准 ，正确度甚至超过了那些慢吞吞的物理学步骤 。并且 IsoDDE 出格擅利益理那些长得和训练数据齐全不一样的分子 。美国哥伦比亚大学的推算机生物学家穆罕默德·阿尔库莱希（Mohammed AlQuraishi ）公开暗示 ，这意味着 IsoDDE 解决了最难的问题 ，也意味着背后研发人员注定使用了很新的招数 。
IsoDDE 还能够预测抗体怎么和抗原结合 。对于抗体我们应该都不陌生 ，新冠疫情期间各人天天测试的就是抗体 �？固逡┐丝淌窃煲┝煊虻南纸鸫竽膛� ，每年销售额达到几百亿英镑 。但是 ，设计抗体极度难题 ，由于它有一个 CDR-H3 的环状结构 ，不仅千变万化 ，并且很难预测 。IsoDDE 在这个环节上 ，其正确率竟然比 AlphaFold 3 逾越 2.3 倍 ，比 Boltz-2 逾越将近 20 倍 。
IsoDDE 还有一个找口袋的能力 。蛋白质表表有一些凹陷的处所 ，药物分子能够钻进去 。有的口袋藏得很深 ，平时看不见 ，只有特定分子靠近才会露出来 。IsoDDE 则能从蛋白质的氨基酸序列启程 ，直接找到这些暗藏的口袋 。据相识 ，背后研发人员使用一种名为 cereblon 的蛋白做测试 ，这个蛋白占有一幼我类使用了几十年的经典口袋 ，同时还有一个刚于 2026 年被发现的暗藏口袋 。而只需使用序列信息 ，IsoDDE 就能把这两个口袋全数找到 。
目前 ，Isomorphic Labs 已经将其用于各类新药项目 ，蕴含以前那些出格难搞的靶点 。所谓难搞就是蛋白质表表光溜溜的 ，找不到口袋下手 ，或者口袋太深 ，药物钻不进去 。而 IsoDDE 则能援手人们找到突破口 。
那么 ，这么严害的器材 ，为何不开源？Isomorphic Labs 的选择其实不难理解 。造药是几百亿的生意 ，谁先找到新药谁就能赚大钱 ，把主题技术藏着自己用在贸易上很合理 ，但是科学进取本就依赖分享和验证 ，你把最严害的兵器锁在柜子里 ，别人就没法验证 ，也没法改进 ，整个领域的发展快率就会慢下来 。
两年前 AlphaFold 3 颁布的时辰 ，也是只给了论文没有给代码 ，被骂了一通之后才盛开 。这次 IsoDDE 索性连论文都不发 ，只给了一份技术汇报 。但无论若何 ，IsoDDE 让人们看到了 AI 设计药物的新高度 。蛋白质折叠的问题解决之后 ，下一个问题就是若何设计出来治病的分子 。Isomorphic Labs 背后的谷歌显然不想只当一个发论文的 ，他们也想亲自下场做出能吃的药 ，以及启发新的业务增长点 。
事实上 ，IsoDDE 被称之为“AlphaFold 4”并非仅仅由于它在职能上和 AlphaFold 有着一脉相承的风格 ，背后公司 Isomorphic Labs 更是直接由凭借 AlphaFold 获得诺奖的 DeepMind 首创人戴女士·哈萨比斯（Demis Hassabis）亲自下场担任首创人和 CEO 。
该公司的科学照拂委员会同样是“含诺量”十足 ，凭借开发 CRISPR/Cas9 基因编纂技术而获得诺奖的詹妮弗·杜德纳（Jennifer A. Doudna）以及凭借开发不合称有机催化而获得诺奖的大卫·麦克米伦（David W.C. MacMillan）都在这里担任科学照拂 。
因而 ，说这家公司是全球科研布景最强的公司之一可能并不为过 ，而下一次 Isomorphic Labs 再被爆出大新闻的时辰 ，也许是带着新药呈此刻新闻稿或颁布会上的时辰 。
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